MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 123609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010943	CCG	2	6	46	51	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572092
2	NC_010943	TCG	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572092
3	NC_010943	CTG	2	6	178	183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572092
4	NC_010943	CGCGCC	2	12	227	238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572092
5	NC_010943	TCG	2	6	347	352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572092
6	NC_010943	GCA	2	6	359	364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572092
7	NC_010943	GCC	3	9	379	387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572092
8	NC_010943	GGC	2	6	393	398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572092
9	NC_010943	CG	3	6	415	420	0 %	0 %	50 %	50 %	190572092
10	NC_010943	GCT	3	9	429	437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572092
11	NC_010943	CGC	2	6	477	482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572092
12	NC_010943	TTC	2	6	544	549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572092
13	NC_010943	GAT	2	6	555	560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572092
14	NC_010943	CAG	2	6	607	612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572092
15	NC_010943	GCT	2	6	621	626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572092
16	NC_010943	TTC	2	6	643	648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572092
17	NC_010943	TTC	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572092
18	NC_010943	GTT	2	6	696	701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572092
19	NC_010943	AGC	2	6	710	715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572092
20	NC_010943	ATC	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572092
21	NC_010943	CG	3	6	743	748	0 %	0 %	50 %	50 %	190572092
22	NC_010943	GC	3	6	766	771	0 %	0 %	50 %	50 %	190572092
23	NC_010943	GTCG	2	8	798	805	0 %	25 %	50 %	25 %	190572092
24	NC_010943	CCG	2	6	814	819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572092
25	NC_010943	CGC	2	6	834	839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572092
26	NC_010943	GAT	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572092
27	NC_010943	AAG	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572092
28	NC_010943	GC	3	6	941	946	0 %	0 %	50 %	50 %	190572092
29	NC_010943	CCGC	2	8	959	966	0 %	0 %	25 %	75 %	190572092
30	NC_010943	CG	3	6	982	987	0 %	0 %	50 %	50 %	190572092
31	NC_010943	CAC	2	6	990	995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572092
32	NC_010943	CTG	2	6	1024	1029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572092
33	NC_010943	CAG	3	9	1036	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572092
34	NC_010943	ACT	2	6	1082	1087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572092
35	NC_010943	CTG	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572092
36	NC_010943	CGCT	2	8	1129	1136	0 %	25 %	25 %	50 %	190572092
37	NC_010943	CAC	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572092
38	NC_010943	TGC	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572092
39	NC_010943	TGCC	2	8	1245	1252	0 %	25 %	25 %	50 %	190572092
40	NC_010943	ATG	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572092
41	NC_010943	TTTA	2	8	1501	1508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010943	GTT	2	6	1521	1526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010943	CAC	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010943	T	6	6	1579	1584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010943	GTC	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572093
46	NC_010943	CGC	2	6	1674	1679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572093
47	NC_010943	ACC	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572093
48	NC_010943	CCCG	2	8	1815	1822	0 %	0 %	25 %	75 %	190572093
49	NC_010943	ATC	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572093
50	NC_010943	GGCC	2	8	1904	1911	0 %	0 %	50 %	50 %	190572093
51	NC_010943	CAG	2	6	2046	2051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572093
52	NC_010943	CTA	2	6	2060	2065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572093
53	NC_010943	CTG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572093
54	NC_010943	GCG	2	6	2092	2097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572093
55	NC_010943	TGCGC	2	10	2099	2108	0 %	20 %	40 %	40 %	190572093
56	NC_010943	TG	3	6	2140	2145	0 %	50 %	50 %	0 %	190572093
57	NC_010943	ATC	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572093
58	NC_010943	CTG	2	6	2223	2228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572093
59	NC_010943	GCG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572093
60	NC_010943	CGA	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572093
61	NC_010943	TCACCT	2	12	2296	2307	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	190572093
62	NC_010943	GC	3	6	2411	2416	0 %	0 %	50 %	50 %	190572093
63	NC_010943	GC	3	6	2485	2490	0 %	0 %	50 %	50 %	190572093
64	NC_010943	GAA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572093
65	NC_010943	CTG	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572093
66	NC_010943	GAG	2	6	2607	2612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572093
67	NC_010943	TCA	2	6	2614	2619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572093
68	NC_010943	CAG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572093
69	NC_010943	CAG	2	6	2709	2714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010943	T	9	9	2760	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010943	TGC	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010943	GGAT	2	8	2988	2995	25 %	25 %	50 %	0 %	190572094
73	NC_010943	GTTG	2	8	3057	3064	0 %	50 %	50 %	0 %	190572094
74	NC_010943	TGG	2	6	3117	3122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572094
75	NC_010943	TGG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572094
76	NC_010943	G	7	7	3220	3226	0 %	0 %	100 %	0 %	190572094
77	NC_010943	T	6	6	3263	3268	0 %	100 %	0 %	0 %	190572094
78	NC_010943	C	6	6	3362	3367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_010943	GCATC	2	10	3371	3380	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_010943	CG	3	6	3398	3403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010943	CCG	2	6	3417	3422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010943	GCC	2	6	3491	3496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010943	CCA	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010943	GC	3	6	3618	3623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010943	GGCT	2	8	3627	3634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010943	CCG	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572095
87	NC_010943	CTG	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572095
88	NC_010943	GCCAGG	2	12	3888	3899	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190572095
89	NC_010943	CGC	2	6	3948	3953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572095
90	NC_010943	CCG	2	6	3955	3960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572095
91	NC_010943	GTG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572095
92	NC_010943	G	8	8	4094	4101	0 %	0 %	100 %	0 %	190572095
93	NC_010943	TC	3	6	4156	4161	0 %	50 %	0 %	50 %	190572095
94	NC_010943	AGC	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572095
95	NC_010943	TGCTC	2	10	4201	4210	0 %	40 %	20 %	40 %	190572095
96	NC_010943	GCC	2	6	4284	4289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572095
97	NC_010943	GCA	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572095
98	NC_010943	GCC	2	6	4334	4339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572095
99	NC_010943	GGC	3	9	4389	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572095
100	NC_010943	TCGG	2	8	4463	4470	0 %	25 %	50 %	25 %	190572095
101	NC_010943	GGCCA	2	10	4535	4544	20 %	0 %	40 %	40 %	190572095
102	NC_010943	GCCT	2	8	4559	4566	0 %	25 %	25 %	50 %	190572095
103	NC_010943	GCG	2	6	4599	4604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572095
104	NC_010943	TCA	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572095
105	NC_010943	CGG	2	6	4725	4730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572095
106	NC_010943	GCT	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572095
107	NC_010943	CGA	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572096
108	NC_010943	AAC	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572096
109	NC_010943	ACG	2	6	4951	4956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572096
110	NC_010943	CAC	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572096
111	NC_010943	GTC	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572096
112	NC_010943	TCGA	2	8	5076	5083	25 %	25 %	25 %	25 %	190572096
113	NC_010943	GGCC	2	8	5093	5100	0 %	0 %	50 %	50 %	190572096
114	NC_010943	GTC	2	6	5232	5237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572096
115	NC_010943	GGC	2	6	5256	5261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572096
116	NC_010943	CGA	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572096
117	NC_010943	GGC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572096
118	NC_010943	CGGCGT	2	12	5303	5314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190572096
119	NC_010943	GCT	2	6	5342	5347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572096
120	NC_010943	CAG	2	6	5379	5384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572096
121	NC_010943	ACC	3	9	5430	5438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572096
122	NC_010943	CGC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572096
123	NC_010943	CGA	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572096
124	NC_010943	CGC	2	6	5659	5664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572096
125	NC_010943	TCG	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572096
126	NC_010943	CAA	2	6	5768	5773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572096
127	NC_010943	CGG	2	6	5789	5794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572096
128	NC_010943	CAA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572096
129	NC_010943	CGA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572096
130	NC_010943	CCAG	2	8	5956	5963	25 %	0 %	25 %	50 %	190572096
131	NC_010943	CGG	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572096
132	NC_010943	GC	3	6	6021	6026	0 %	0 %	50 %	50 %	190572096
133	NC_010943	CGAA	2	8	6052	6059	50 %	0 %	25 %	25 %	190572096
134	NC_010943	TCG	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572096
135	NC_010943	CGC	2	6	6089	6094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572096
136	NC_010943	GC	4	8	6093	6100	0 %	0 %	50 %	50 %	190572096
137	NC_010943	GCG	2	6	6108	6113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572096
138	NC_010943	CGC	2	6	6135	6140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572096
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199	NC_010943	CGCTA	2	10	8313	8322	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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262	NC_010943	GCC	5	15	10816	10830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572100
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264	NC_010943	CCG	4	12	10865	10876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572100
265	NC_010943	GAA	2	6	10879	10884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572100
266	NC_010943	CGC	2	6	10890	10895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572100
267	NC_010943	CGC	4	12	10914	10925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572100
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269	NC_010943	C	6	6	10985	10990	0 %	0 %	0 %	100 %	190572100
270	NC_010943	GCC	2	6	10993	10998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572100
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272	NC_010943	TCG	2	6	11036	11041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572100
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274	NC_010943	GCCG	2	8	11068	11075	0 %	0 %	50 %	50 %	190572100
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276	NC_010943	CGC	2	6	11224	11229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572100
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280	NC_010943	CAC	2	6	11362	11367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_010943	AC	3	6	11366	11371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_010943	TGC	2	6	11389	11394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572101
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308	NC_010943	CG	3	6	12156	12161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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342	NC_010943	T	9	9	13115	13123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_010943	TGCC	2	8	13125	13132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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382	NC_010943	ATC	2	6	14638	14643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_010943	CTG	3	9	14673	14681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572105
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388	NC_010943	CTG	2	6	14763	14768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572105
389	NC_010943	GAG	2	6	14841	14846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572105
390	NC_010943	GCC	2	6	14851	14856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572105
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392	NC_010943	CGC	2	6	14877	14882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572105
393	NC_010943	AGT	2	6	14923	14928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572105
394	NC_010943	CGTCAA	2	12	14951	14962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190572106
395	NC_010943	CG	3	6	14986	14991	0 %	0 %	50 %	50 %	190572106
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400	NC_010943	CCG	2	6	15077	15082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572106
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422	NC_010943	AAT	2	6	16074	16079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_010943	CAGT	2	8	19319	19326	25 %	25 %	25 %	25 %	190572111
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483	NC_010943	GTG	2	6	19910	19915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
484	NC_010943	ACCTT	2	10	19932	19941	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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486	NC_010943	TGA	2	6	20040	20045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_010943	CGA	2	6	20149	20154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_010943	CT	3	6	20165	20170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
490	NC_010943	CTTC	2	8	20203	20210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_010943	AT	3	6	20248	20253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_010943	GTT	2	6	20294	20299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
493	NC_010943	A	8	8	20322	20329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_010943	CAG	2	6	20467	20472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572112
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497	NC_010943	A	6	6	20623	20628	100 %	0 %	0 %	0 %	190572112
498	NC_010943	TGAC	2	8	20679	20686	25 %	25 %	25 %	25 %	190572112
499	NC_010943	CGC	3	9	20716	20724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572112
500	NC_010943	GCT	2	6	20806	20811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572112

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